Протоны водорода образуются при фотолизе воды.
h2o = 2h^(+) + o2 + 2e
Далее НАДФ+ забирает электроны от переносчиков и 2Н^(+), восстанавливаясь до НАДФН+Н^(+). Этот продукт переходит в темновую фазу.
Темновая фаза:
В цикле Кальвина НАДФН+Н^(+) восстанавливает, те отдает 2Н^(+) образующимся органическим веществам, из которых в конце получается глюкоза.