По всей видимости, беглецы спрятались в старом флигеле (1) и (2) если вы не боитесь ожечься о крапиву (3) то пойдёмте по тропинке и посмотрим (4) что делается внутри.
Запятая 2 НЕ СТАВИТСЯ, так как у союза ЕСЛИ есть соотносительное слово ТО.
Запятая 3 обозначает границу предложения «если вы не боитесь ожечься о крапиву»
Запятая 4 выделяет придаточное предложение «что делается внутри».
Запятые должны стоять на местах 1, 3 и 4